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Citrobacter sp.

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Espèces répertoriées :
- Complexe Citrobacter freundii : C. freundii stricto sensu, C. braaki, C. gillenii, C. murliniae, C. rodentium, C. sedlakii, C. werkmanii, C. youngae
- Citrobacter koseri
- Citrobacter farmeri
- Citrobacter amalonaticus
- Citrobacter pasteurii

    Classification :
  • Proteobacteria
  • Gammaproteobacteria
  • Enterobacteriales
  • Enterobacteriaceae
    Examen direct :
    • Bacilles Gram négatif
    • Coloration bipolaire
    • État frais : mobilité (ciliature péritriche)
    Culture :
    • Morphologie :
      • Grosses colonies rondes et lisses, à bords réguliers
    Habitat naturel :
  • Flore commensale digestive de l’homme et des animaux (mammifères, oiseaux)
  • Environnement (plantes, sol, eaux)
  • Aliments
    Facteurs de virulence :
  • Peu étudiés.
    Épidémiologie :
  • Origine majoritairement nosocomiale
  • Bactéries opportunistes
  • Résistance des souches en augmentation
  • Méningites néonatales à Citrobacter koseri : mortalité importante, 75% de séquelles neurologiques
    Pathogénicité :
  • Infections urinaires
  • Infections gastro-intestinales (diarrhées, péritonites)
  • Infections respiratoires
  • Infections cutanéomuqueuses
  • Bactériémies
  • Méningites néonatales (C. koseri), complication = abcès cérébral
    Prélèvement :
    • Urines
    • Sang pour hémocultures
    • Selles
    • Liquides de ponction
    • Suppurations diverses
    • Prélèvement vaginal
    • Prélèvements respiratoires

    Réalisation de l'examen direct
    Mise en culture :
    • Bactéries non exigeantes
    • Respiration : aéro-anaérobie facultative
    • Milieux : milieux usuels, milieux chromogènes
    • Incubation : 37°C, air ambiant
    Identification :
    • Caractéristiques biochimiques d'orientation :
      • Catalase positive
      • Oxydase négative
    • MALDI-TOF couplé à la spectrométrie de masse (attention confusion entre les espèces proches)
    • Galeries d'identification bactérienne
    Résistances naturelles :
    • C. koseri, C. farmeri, C. amalonaticus : groupe 2 des Entérobactéries (pénicillinase de bas niveau)
    • C. freundii, autres Citrobacter : groupe 3 des Entérobactéries (céphalosporinase chromosomique, gène AmpC)

    Résistances acquises aux β-lactamines :
    • Pénicillinases de haut niveau
    • Céphalosporinases hyperproduites
    • β-lactamases à spectre étendu
    • Carbapénémases
    Traitement curatif :
  • Choix des molécules selon le site de l'infection et l'antibiogramme
  • Citrobacter du groupe 3 des Entérobactéries : risque de sélection de mutants résistants en cas d'utilisation en monothérapie des céphalosporines de 3ème génération, risque très diminué avec le céfépime
    Prophylaxie :
  • Contrôle de l'immunodépression
  • Respect des mesures d'hygiène des mains
  • Respect des bonnes pratiques d'hygiène hospitalière